Dipl.-Biol. Carlo Berg
Seestrasse 15
D-18119 Rostock
Forschung
Doktorand im DFG-Projekt MOCA: Microbial Oceanography of ChemolithoAutotrophic Planktonic Communities
Thema: "Ecological role of planktonic Thaumarchaeota in the central Baltic Sea"
Betreuer: Prof. Klaus Jürgens
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Im Rahmen des DFG und ESF Projekts "MOCA" beschäftige ich mich mit der Rolle der potentiell Ammonium oxidierenden Thaumarchaeota in der zentralen Ostsee mittels Quantifizierung, biogeochemischen Aktivitätsbestimmungen (CO2-Fixierungsraten, Nitrifikationsraten) und Anreicherungsexperimenten dieser Mikroorganismen. Dabei kommen Methoden wie CARD-FISH, 15NH4 und 14C Inkubationen, Metatranskriptom- und 16S rRNA Analysen zum Einsatz um die Bedeutung und den Einfluss der Thaumarchaeota auf den pelagischen Stickstoff- und Kohlenstoffkreislauf in pelagischen Redoxklinen der zentralen Ostsee aufzuklären. Mehr Informationen: |
Gefördert von:
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Publikationen (peer-reviewed)
- Berg, C., Beckmann, S., Jost, G., Labrenz, M., Jürgens, K. (2013) Acetate-utilizing bacteria at an oxic-anoxic interface in the Baltic Sea. FEMS Microbiology Ecology. DOI: 10.1111/1574-6941.12114
Vorträge
- Berg, Carlo, Vandieken, V., Thamdrup, B., Jürgens, K. Significance of archaeal nitrification in hypoxic waters of the Baltic Sea. Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie (VAAM) 2013, Bremen, Deutschland, 11.3.2013
- Berg, Carlo. Nitrifizierende Archaeen als mikrobielle Schlüsselorganismen im Stickstoffkreislauf der Ostsee. Vortrag anlässlich "20 Jahre IOW", Rostock-Warnemünde, 1.6.2012
- Berg, Carlo, Vandieken, V., Thamdrup, B., Jürgens, K. Significance of archaeal nitrification in hypoxic waters of the Baltic Sea. European Geosciences Union General Assembly (EGU) 2012, Wien, Österreich, 25.4.2012
Poster
- Berg, Carlo, Vandieken, V., Thamdrup, B., Jürgens, K. Significance of archaeal nitrification in sulfide influenced hypoxic waters of the Baltic Sea. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Kopenhagen, Dänemark, 19.-24.8.2012.
- Berg, Carlo, Labrenz, M., Beckmann, S., Jost, G., Jürgens, K. Identification of acetate incorporating Arcobacter spp. as potential manganese reducers in pelagic redoxclines of the central Baltic Sea via 16S rRNA based 13C stable isotope probing. VAAM 2012, Tübingen, Deutschland, 18.-21.3.2012
- Berg, Carlo, Vandieken, V., Thamdrup, B., Jürgens, K. Significance of archaeal nitrification in hypoxic waters of the Baltic Sea. Wissenschaftlicher Beirat des IOW, 29.2.2012
- Berg, Carlo, Labrenz, M., Beckmann, S., Jost, G., Jürgens, K. Identification of acetate incorporating Arcobacter spp. as potential manganese reducers in pelagic redoxclines of the central Baltic Sea via 16S rRNA based 13C stable isotope probing. 12th Symposium on Aquatic Microbial Ecology (SAME 12), Rostock, Deutschland, 28.8.-2.9.2011
- Glaubitz, S., Berg, Carlo, Abraham, W.-R., Jost, G., Labrenz, M., Jürgens, K. Utilization of organic carbon by a chemoautotrophy-dominated microbial community in a pelagic redoxcline of the central Baltic Sea. Wissenschaftlicher Beirat des IOW, 3.3.2011
Detektion der Thaumarchaeota mithilfe von Fluoreszenzmikroskopie und Gensonden (CARD-FISH)
CARD-FISH ist eine sensitive Methode um Zellen bestimmter prokaryotischer Gruppen spezifisch mit Hilfe von Gensonden anzufärben. Links zu sehen sind alle unspezifisch mit dem Farbstoff DAPI angefärbten Zellen aus einer pelagischen Redoxkline der Ostsee; auf der rechten Seite dieselbe Probe mit Zellen, die mit der Thaumarchaeota-spezifischen Sonde Cren679 hybridisiert sind (Labrenz et al. 2010).
(CARD-FISH = catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization)
Diplomarbeit und Studium
Titel: "Identification of active microorganisms in pelagic redoxclines of the central Baltic Sea" (2010)
Ausleihbestand siehe Universitätsbibliothek Rostock
Betreuer: PD Dr. Matthias Labrenz
- Universtität Rostock
10/2004 bis 08/2010 - Universität Umeå, Schweden (ERASMUS Programm)
08/2008 bis 04/2009
Forschungsausfahrten
- Juni 2012: Meteor M87/3b (zentrale Ostsee)
Probenahme für Doktorarbeit - Nov 2011: Meteor M86/1b (zentrale Ostsee)
Probenahme für Doktorarbeit - Juli 2011: Elisabeth M. Borgese EMB1 (zentrale Ostsee)
Probenahme für Doktorarbeit - Okt 2009: Alkor (zentrale Ostsee)
Probenahme und RNA-SIP Experimente für Diplomarbeit - Juni 2008: Maria S. Merian MSM8/3 (Tallinn-Kiel)
Wissenschaftliche Hilfskraft zur Probenahme - Feb 2008: Maria S. Merian MSM7/2a (Las Palmas-Walvis Bay/Namibia)
Praktikum zu "Untersuchung der Verteilung von Bchl a und Aeroben Anoxygenen Phototrophen (AAP) Bakterien im Atlantik"